Половые хромосомы - хромосомы, осуществляющие генетический контроль появления особей мужского и женского пола.

К половым хромосомам относятся Х- и Y-хромосомы (см. Кариотип человека). Сочетание в геноме двух идентичных Х-хромосом определяет женский пол, а одной Х-хромосомы с Y- хромосомой — мужской пол. Морфологически половые хромосомы отличаются от всех остальных хромосом (аутосом) набора. Y-хромосома по размерам обычно намного меньше Х-хромосомы, менее активна и несёт меньше генов, чем Х-хромосома.

Утрата или избыток половых хромосом в геноме ведёт к серьёзным нарушениям функционирования организмов. У человека особи с набором половых хромосом XXY, XXXY, XXXXY, XXXYY, XXYY имеют мужской габитус, характеризующийся умственной отсталостью и бесплодием; с ХО - женский габитус с теми же дефектами. Больные с аномалиями половых хромосом из-за нарушений полового развития и нередко выраженных эндокринопатий, как правило, не имеют потомства. См. также Наследственные болезни, Хромосомные болезни.